Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms