Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms