Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms