Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Mrpl28Q9D1B9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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