Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms