Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MINDY3Q9CV28 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms