Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CR55 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CR55 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CR55 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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