Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms