Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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