Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99KU6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99KU6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99KU6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms