Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms