Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE6

Cdkal1, Threonylcarbamoyladenosine tRNA methylthiotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkal1Q91WE6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms