Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms