Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4aQ8C9S8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Atg4aQ8C9S8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Atg4aQ8C9S8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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