Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Aph1bQ8C7N7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Aph1bQ8C7N7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Aph1bQ8C7N7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Aph1bQ8C7N7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Aph1bQ8C7N7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Aph1bQ8C7N7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Aph1bQ8C7N7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Aph1bQ8C7N7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Aph1bQ8C7N7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aph1bQ8C7N7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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