Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C1R3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms