Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TiparpQ8C1B2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TiparpQ8C1B2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms