Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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