Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rccd1Q8BTU7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms