Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms