Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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