Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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