Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms