Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms