Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms