Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VclQ64727 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VclQ64727 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VclQ64727 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VclQ64727 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VclQ64727 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms