Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm5dQ62240 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms