Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms