Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc11Q5U458 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms