Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Xirp2Q4U4S6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms