Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms