Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pfdn4Q3UWL8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pfdn4Q3UWL8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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