Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcho2Q3UQN2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho2Q3UQN2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms