Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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