Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx27Q3UHD6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms