Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll12Q3UDE2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms