Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms