Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrrn4clQ3TYX2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrrn4clQ3TYX2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrrn4clQ3TYX2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrrn4clQ3TYX2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrn4clQ3TYX2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrn4clQ3TYX2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrn4clQ3TYX2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrn4clQ3TYX2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn4clQ3TYX2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrn4clQ3TYX2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrrn4clQ3TYX2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrrn4clQ3TYX2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrrn4clQ3TYX2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrrn4clQ3TYX2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrrn4clQ3TYX2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Lrrn4clQ3TYX2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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