Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms