Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdss2Q33DR3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms