Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms