Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms