Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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