Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msx2Q03358 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms