Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RykQ01887 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RykQ01887 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RykQ01887 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RykQ01887 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RykQ01887 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RykQ01887 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RykQ01887 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RykQ01887 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RykQ01887 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RykQ01887 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RykQ01887 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RykQ01887 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RykQ01887 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RykQ01887 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms