Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cited1P97769 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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