Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms