Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll3P85442 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms