Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 299 ms