Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sem1P60897 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sem1P60897 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sem1P60897 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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